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我們?yōu)榱丝锤?xì)的結(jié)構(gòu)，通常采用光學(xué)放大系統(tǒng)來(lái)幫助我們觀察，這就是傳統(tǒng)的顯微鏡。但是受到光波繞射的限制，傳統(tǒng)顯微鏡無(wú)法提供無(wú)限的放大能力，且成像方式亦不離平面成像。
在1955 年，Marvin Minsky 一個(gè)在眼鏡制造工廠工作的員工，為了觀察 sample 腦部的神經(jīng)活性組織 DNA 的變化，
發(fā)展出另一套顯微鏡系統(tǒng)，也就是現(xiàn)今所謂的共軛焦顯微鏡（Confocal microscope）系統(tǒng)
早先的共軛顯微鏡結(jié)構(gòu)是依據(jù)一般的光學(xué)（螢光）顯微鏡為整體基礎(chǔ)架構(gòu)，在光源方面則以鋯燈（Zirconium arc source）及兩組濾孔（pinhole）、
一組偏光鏡。其原理在于共軛焦顯微鏡可藉由去除非焦面所產(chǎn)生的雜訊，以取得在樣本中不同深度之高解析度顯微影像。
其主要原理可分為三個(gè)步驟來(lái)說(shuō)說(shuō)明：首先雷射光線可以經(jīng)由物鏡聚焦成單一的光點(diǎn),來(lái)照射樣品單點(diǎn)的特定深度；
由焦點(diǎn)反射或發(fā)散的光線還可經(jīng)由物鏡聚焦成單一的光束，完全通過(guò)影像偵測(cè)器前的濾孔（pinhole），進(jìn)而達(dá)到所欲測(cè)定之不同深度的顯微影像。
使用濾孔（pinhole）的目的在于限制光源的方向，使返回光線能通過(guò)并達(dá)到探測(cè)器表面，以屏蔽掉不對(duì)焦的光線，以及樣品探測(cè)點(diǎn)外散射光的干擾。
其結(jié)果可以形成這一探測(cè)點(diǎn)的更完整影像。因此它能針對(duì)特定的光學(xué)斷層，觀察到較清晰的組織影像，且可清楚顯示樣品內(nèi)部(厚度可達(dá) 10μm)
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