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蛋白質的合成過程是有計劃的執行
負責合成蛋白質的遺傳訊息分為兩階段；
首先是DNA必須先轉錄 (transcribe) 成訊息RNA (messenger RNA, mRNA)，
接下來的步驟則藉由mRNA所攜帶的訊息以合成多勝肽(polypeptide)，由核酸的所用語言轉換成蛋白質語言，
此過程則成為轉譯 (translation)。而此在細胞內遺傳訊息由DNA轉換成RNA
蛋白質為基因的產物
基因產物 (gene product)是基因表現的最終產物，一般為蛋白質，但細胞內各種tRNA、rRNA及snRNA等等的非轉譯型RNA也屬于基因產物。
已知有些單一基因即可能具帶有數種蛋白質的編碼 (encode)。
在真核細胞中，單一條mRNA分子只帶有單一基因的遺傳訊息，因此只能轉譯出單一種蛋白質。
病毒透過本身特別長的mRNA，制造出一條巨大的“多蛋白質 (polyprotein)”。這條多蛋白質隨后被切割成數條序列較短的蛋白質。
在很偶然的情況下，真核細胞的單一條基因可能會因讀取框架位移 (frame shifting) 而產生兩種不同蛋白質。
一般常將細胞內所有遺傳訊息的總和稱為基因體 (genome)。因此細胞內產生的所有蛋白總和稱為蛋白質體 (proteome)。在細菌中，基因與蛋白質之間幾乎都是一對一的對應關系 (one-for-one correspondence)。然而較高等生物發生選擇性的剪接 (alternative splicing)，因此一條基因最后可能會產生2～3種不同蛋白質，也因此可知蛋白質體的數量遠比基因體來得大。
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