豐臺兒童顯微鏡推薦毛友東和歐陽邵研究小組在《自
作者: 發布時間:2022-07-02 17:33:20點擊:1673
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利用冷凍電子顯微鏡技術,結合毛友東和歐陽邵的研究小組及其合作者,分析了人蛋白酶體26S總酶的三種亞穩態變性高分辨結構。在相同的樣品中得到核心粒子(CP)基片,其轉運通道兩態的近原子分辨三維動態結構被打開和關閉。觀察了修飾條件,為蛋白酶體CP門控開關的激活機制和調控顆粒中底物轉運通道的動力學機制提供了重要的結構基礎。2018年4月10日自然通訊。
蛋白酶體是調節細胞內特異蛋白濃度和消除錯誤折疊蛋白的主要機制的核心成分。它是細胞中最常見和不可缺少的大型全酶超分子復合機器之一,也是迄今發現的更大的蛋白質降解機器。由蓋(Lid)和堿(Base)亞復合物組成。2016年,研究小組及其合作者報告了人類蛋白酶體的基態近原子分辨低溫電子顯微結構以及三個亞納米分辨RP-CP亞復合物的亞穩態或過渡態共存。復合物,并且發現CP的亞穩構象之一處于底物傳輸通道。開放狀態(參見PNAS 2016,113:12991-12996)。這一發現被進一步證實,引用并被Ba在2017年《美國科學院學報》上的一篇論文進行比較。德國馬薩諸塞研究所的umeister研究小組(參見PNAS 2017,114,1305-1310)。然而,在這些研究中,CP的開放態結構仍遠未達到原子分辨率,并且活化后人蛋白酶體全酶的運動行為尚未完全揭示。工作中,毛友東和歐陽邵的研究小組及其合作者使用他們自己的高性能計算軟件ROME(參見PLoS ONE 2017,12:e0182130),基于統計流行算法和優化的冷凍電子顯微鏡處理方法來分析全酶f。人蛋白酶體與ATP-γS結合的reeze-electronic顯微鏡片。共存6個動態結構,包括3.6A分辨率的基態結構、3.5A開放態的CP結構和3個相應的亞穩態退化總酶4.2A、4.3A和4.9A結構的CP開放態。另外兩個中間態的結構分辨力分別為7和5.8。三個CP開放態的主要區別在于,位于RP中的AAA-ATPase激酶馬達模塊至少有4個ATP-γS分子穩定地結合到不同的AAA-ATPase亞基上,這提供了本研究觀察了位于AAA-ATPase激酶運動模塊中心的底物轉運通道從螺旋到鞍的拓撲變化。為進一步分析底物與蛋白酶體全酶的相互作用奠定了重要基礎。
北京大學定量生物學中心博士生朱延南和訪問學者王偉立博士是合著者。北京大學物理學院定量生物學中心的毛澤東和哈佛醫學院的助理教授陸英是合著者。本課題由青年計劃、基金委員會、北京大學清華生命科學聯合中心、學校985計劃、介觀物理重點實驗室、智能并行計算研究基金資助。美國國立衛生研究院。
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