豐臺顯微鏡配件回收毛友東和歐陽琦研究小組及其合
作者: 發(fā)布時間:2022-07-02 17:33:21點擊:1713
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與哈佛醫(yī)學(xué)院吳昊教授、北京大學(xué)物理定量生物學(xué)院吳昊教授和歐陽杰教授以及北京大學(xué)物理學(xué)院毛友東教授合作,對炎癥的三維結(jié)構(gòu)進行了分析。用近紅外電子顯微鏡研究近原子分辨率的配合物。這是解釋復(fù)合物在免疫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用單向聚合物激活的分子結(jié)構(gòu)機制。這項研究發(fā)表在2015年10月8日的《國際期刊》網(wǎng)上,主題是活化的NAPP2/NLRC4炎癥體的低溫-EM結(jié)構(gòu)。揭示有核聚合反應(yīng)。
先天免疫是人類免疫系統(tǒng)的重要組成部分。炎癥復(fù)合物是細胞質(zhì)中一組復(fù)雜的多蛋白復(fù)合物,在觸發(fā)先天免疫應(yīng)答中起重要作用,從而觸發(fā)免疫應(yīng)答和炎癥應(yīng)答,如細胞凋亡。它們是半胱氨酸蛋白酶活化所必需的反應(yīng)平臺。復(fù)合單體由多個結(jié)構(gòu)域組成,通過上游蛋白質(zhì)的激活而誘導(dǎo)其組裝成環(huán)狀復(fù)合物,炎癥復(fù)合物在理解先天免疫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫調(diào)節(jié)和病原體誘導(dǎo)激活中起著關(guān)鍵作用。因此,已成為國內(nèi)外結(jié)構(gòu)生物學(xué)和免疫學(xué)實驗室的熱門研究對象。
細胞中的大多數(shù)蛋白質(zhì)復(fù)合物表現(xiàn)出一定的分子力學(xué)效應(yīng),在信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和生化調(diào)節(jié)方面表現(xiàn)出構(gòu)象異質(zhì)性和動力學(xué),使得傳統(tǒng)的結(jié)構(gòu)分析方法,如X射線晶體學(xué)和核磁共振,都具有廣泛的應(yīng)用前景。單粒子低溫電子顯微鏡突破了傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)分析方法的許多局限,使得高分辨率的結(jié)構(gòu)分析可以直接在單分子水平上進行。應(yīng)用傳統(tǒng)的結(jié)構(gòu)分析方法,在病原體激活后,炎癥復(fù)合物在細胞質(zhì)中自發(fā)組裝成多個準(zhǔn)對稱和不完全的復(fù)合物,炎癥復(fù)合物可以隨機組裝成準(zhǔn)10、11和12倍的對稱復(fù)合物。由于炎性復(fù)合物具有動態(tài)的蛋白單體,這些結(jié)構(gòu)的分子量差異非常小,現(xiàn)有的蛋白質(zhì)純化技術(shù)無法分離這些具有不同構(gòu)象的炎性復(fù)合物,且存在高度異質(zhì)性的混淆。由于炎性復(fù)合物分子量大,核磁共振技術(shù)無能為力,低溫電子顯微鏡是本研究的選擇。分析發(fā)現(xiàn),所研究的蛋白質(zhì)具有較高的構(gòu)象均一性,高符合度的低溫電子顯微鏡的構(gòu)象只能達到中、低分辨率。因此,炎癥復(fù)合物的結(jié)構(gòu)分析對現(xiàn)有的低溫電子顯微鏡技術(shù)提出了新的挑戰(zhàn)。毛友東教授和歐陽邵教授的研究小組利用他們的新算法進行低溫選擇。通過并行統(tǒng)計機器學(xué)習(xí),ron顯微數(shù)據(jù)分析,在超級計算機上實現(xiàn)了這些精細動態(tài)構(gòu)象的深度分離,從而提取出高純度的炎性復(fù)合物單粒子圖像的數(shù)據(jù)集,實現(xiàn)高分辨率的三部曲。A-重構(gòu)是可能的。11環(huán)結(jié)構(gòu)具有4.7 A的分辨率,使得有可能對炎癥復(fù)合物的三維原子結(jié)構(gòu)進行建模。
北京大學(xué)定量生物學(xué)中心的博士生陳朔兵和哈佛醫(yī)學(xué)院的博士后學(xué)生張利曼是論文的合著者。北京大學(xué)物理學(xué)院青年千人計劃研究員毛友東是論文的合著者。或者與哈佛醫(yī)學(xué)院講師、美國科學(xué)院院士吳昊教授合寫。這項研究由北京大學(xué)研究基金、北京大學(xué)-清華聯(lián)合生命科學(xué)中心、智能并行計算研究基金資助。美國國立衛(wèi)生研究院。
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